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단백질의 체내 대사 과정은 크게 소화, 흡수, 아미노산 분해 및 이용, 그리고 최종 대사산물 배출의 단계로 나눌 수 있습니다. 첫째, 단백질은 음식을 통해 섭취되면 위장에서 소화가 시작됩니다. 위의 주세포에서 분비되는 펩신(pepsin)이라는 효소가 단백질을 폴리펩타이드로 분해합니다. 이 과정에서는 위액의 강한 산성(pH 1.5~2)이 펩신의 활성화 및 단백질 변성을 돕습니다. 둘째, 부분 분해된 폴리펩타이드가 소장으로 이동하면 이자(췌장)에서 분비되는 트립신, 키모트립신, 카르복시펩티다제 등의 효소가 작용해 폴리펩타이드를 더 작은 올리고펩타이드나 아미노산 단위로 분해합니다. 또한, 소장의 장 점막 세포에서 분비되는 펩티데이스(아미노펩티다제 등)들이 펩타이드 결합을 끊어 최종적으로 아미노산과 소수의 디펩타이드, 트리펩타이드 형태로 분해됩니다. 셋째, 이렇게 분해된 아미노산과 소형 펩타이드들은 소장 점막세포를 통해 흡수됩니다. 디펩타이드와 트리펩타이드는 세포 내에서 최종적으로 아미노산으로 분해된 후 혈류로 방출됩니다. 혈액을 통해 간을 비롯한 전신 조직으로 운반된 아미노산은 체내 단백질 합성에 활용되거나, 에너지원으로 사용되기도 합니다. 넷째, 아미노산이 에너지원으로 사용될 경우에는 먼저 아미노산의 아민기(-NH2)가 제거되는 탈아미노화(deamination) 과정이 일어납니다. 간에서 주로 일어나는 이 과정에서 아민기는 암모니아(NH3) 형태로 분리되고, 이 암모니아는 독성이 있으므로 요소 회로(urea cycle)를 거쳐 요소(urea)로 전환되어 신장을 통해 소변으로 배출됩니다. 나머지 탄소 골격은 글루코스 생성(gluconeogenesis)이나 지방산 합성, 에너지 생성(Citric Acid Cycle) 등에 사용됩니다. 마지막으로, 단백질 대사의 <a href='https://sangseek.com/sangseeks/부산물/ko'>부산물</a>인 요소는 신장에서 걸러져 소변으로 배출되고, 암모니아 등의 독성 물질들은 체내에서 빠르게 제거되어야 하므로 이 과정이 매우 중요합니다. 요약하면, 단백질은 <a href='https://sangseek.com/sangseeks/소화효소/ko'>소화효소</a>에 의해 아미노산으로 분해되어 흡수되고, 신체 내에서 단백질 합성, 에너지 대사, 또는 다른 생화학적 전구체로 사용되며, 탈아미노화 과정에서 생성된 암모니아는 요소로 전환되어 배출되는 과정을 거칩니다.
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